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壮族父系遗传历史研究(复旦大学 广西医科大学研究)(二)(请勿转载)

发表于 2017-3-7 04:58:39|广西 | 查看全部 |阅读模式
本帖最后由 楚越DOCa 于 2017-3-7 05:00 编辑

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1材料与方法

1.1 样品收集和DNA提取

从广西省八个代表性壮族生活区收集了129份血样,分别代表8个壮族分支。使用传统的苯酚-氯仿方法从白细胞中提取DNA【8】。表1显示了不同分支和样本大小的详细信息。所有的个体均为壮族超过三代并且是不相关的健康男性,在招募时被要求签署知情同意书。

1.2 Y染色体双等位基因分型

引入了两种Y-SNP分型策略。对于具有长度变异即缺失或插入的SNP,使用荧光PCR(引物信息显示于表2中),将获得的产物在3100遗传分析仪(ABI公司,美国)上电泳以确定个体的基因型。对于没有长度改变,即取代或颠换的SNP,使用PCR-RFLP(限制性片段长度多态性)[4,6,8-10] 通过两种分型方法的Y-SNP分型结果的综合分析来确定每个受试者的Y单倍群。

1广西壮族8个分支的样本分布

分支
缩写
样本大小
  
邕北
  
  
YB
  
  
23
  
  
右江
  
  
YJ
  
  
5
  
  
桂边/布依
  
  
GB
  
  
4
  
  
红水河
  
  
HSH
  
  
39
  
  
桂北
  
  
GN
  
  
21
  
  
邕南
  
  
YN
  
  
19
  
  
左江/岱依
  
  
ZJ
  
  
15
  
  
德靖/侬
  
  
DJ
  
  
3
  
总和

129

为进行PCR使用了引物混合物,其含有M1750.04μLM1210.03μLM1340.03μL M1170.06μLM1110.08μL;和M150.02μL。每个PCR反应(体积5μL)包括0.5UKodDash聚合酶(TOYOBA),0.26μL引物混合物,10ng基因组DNA和缓冲液。PCR条件如下:9810s552s742s30个循环,最后在4℃扩增。

为了测试不同分支之间的变异程度,使用与用于分型Y-SNP相同的方法分型Y-STR。关于Y-STR引物的信息也示于表2中。每个PCR系统的体积为5μL,含有KodDash聚合酶,0.05μL; 10×缓冲液,0.5μL; dNTP(各2.5mmol / L),0.4μL;基因组DNA10ng;引物混合物,0.4μL。通常,在两个板中进行PCR反应。面板1包括引物对DYS389,0.05μL×2(正向和反向); DYS390,0.07μL×2; DYS391,0.08μL×2;总体积为0.4μL。面板2包括DYS3880.05μL×2; DYS392,0.07μL×2; DYS393,0.02μL×2;DYS19,0.06μL×2
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发表于 2017-5-15 17:10:07|广西 | 查看全部
需要通俗易懂的表述才行
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发表于 2017-5-17 15:02:13|广东 | 查看全部
看不出什么东西。
只想知道结论!呵呵……
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